Zakład Biochemii i Biotechnologii

Zakład Biochemii i Biotechnologii realizuje prace badawcze, których celem jest analiza zjawisk zachodzących w gatunkach roślin użytkowych pod wpływem stresów abiotycznych oraz biotycznych na poziomie podstawowym, identyfikacja i opracowanie zależności czynników determinujących wystąpienie zachodzących zjawisk, opracowanie ich mechanizmów oraz wskazanie możliwości wykorzystania zdobytej wiedzy w praktyce.

1. Badania z zakresu embriologii eksperymentalnej i somatycznej embriogenezy. Poznanie na poziomie fizjologicznym, cytogenetycznym, biochemicznym, metabolitycznym, genetycznym, epigenetycznym oraz transkrypcyjno-translacyjnym procesów zachodzących w kulturach in vitro sprzyjających regeneracji roślin. Badanie roli czynników abiotycznych (takich jak światło czy jony metali, metabolity itd.) na regeneracje roślin na poziomie komórkowym przejawiające się u regenerantów i dziedziczone w cyklach generatywnych. Rozwijanie, na bazie podstaw teoretycznych funkcjonowania kultur in vitro, wydajnych metod regeneracji roślin użytkowych jako istotnego narzędzia do badań podstawowych oraz praktyki rolniczej.

2. Rozwijanie teoretycznych podstaw szeroko rozumianej heterozji u rośli użytkowych ze szczególnym naciskiem na zjawiska zachodzące w systemach cytoplazmatyczno-jądrowej męskiej sterylności na przykładzie zbóż. Poszukiwanie modeli teoretycznych oraz praktycznych zjawiska. Opracowanie wydajnych metod selekcji materiałów roślinnych.

3. Doskonalenie metod badawczych na rzecz hodowli roślin uprawnych, rozwijanie molekularnej platformy bioinformatycznej.

4. Badanie uwarunkowań morfologicznych, fizjologicznych i genetycznych cech użytkowych, (w tym odporności na stresy biotyczne i abiotyczne) roślin rolniczych oraz badanie populacji ważnych gospodarczo patogenów grzybowych roślin użytkowych.

1. Publikacje Zakładu Biochemii i Biotechnologii

1. Czasopisma recenzowane, ze współczynnikiem wpływu IF:

• Niedziela, A., Wasiak, M., Wojciechowska, M., Orłowska, R., Dynkowska, W.M., Bany, S., Bednarek, P.T.  (2022) The 4R QTLs pollen fertility restoration in triticale with CMS Triticum timopheevii. Crop Science. 100 pkt MEiN, IF=2,76. https://doi.org/10.1002/csc2.20819 
• Milarska, S.E., Androsiuk, P., Bednarek, P.T., Larson, K., Giełwanowska, I. (2022) Genetic variation of Cerastium alpinum L. from Babia Góra, a critically endangered species in Poland. Journal of Applied Genetics. 140 pkt MEiN, IF=2,65. https://doi.org/10.1007/s13353-022-00731-x 
• Czembor, J.H.; Czembor, E. (2022) Genome-Wide Association Study of Agronomic Traits in European Spring Barley from Polish Gene Bank. Agronomy, 12:2135. 100 pkt MEiN, IF=3,95. https://doi.org/10.3390/agronomy12092135 
• Pachota, K.A. (2022) Comparison of tissue culture-induced variation in triticale reenerants obtained by androgenesis and somatic embryogenesis. Cereal Research Communications. 20 pkt MEiN, IF=1,24. https://doi.org/10.1007/s42976-022-00300-2 
• Waśkiewicz, A.; Muzolf-Panek, M.; Stępień, Ł.; Czembor, E.; Uwineza, P.A.; Górnaś, P.; Bryła, M. (2022) Variation in Tocochromanols Level and Mycotoxins Content in Sweet Maize Cultivars after Inoculation with Fusarium verticillioides and F. proliferatum. Foods, 11:2781. 100 pkt MEiN, IF=5,56. https://doi.org/10.3390/foods11182781. 
• Orłowska, R., Zebrowski, J.,Zimny, J., Androsiuk, P., Bednarek, P.T. (2022) S-Adenosyl-L-Methionine andCu(II) Impact Green Plant Regeneration Efficiency. Cells,11, 2700. https://doi.org/10.3390/cells11172700
• Pachota, K.A., Orłowska, R. (2022) Effect of copper and silver ions on sequence and DNA methylation changes in triticale regenerants gained via somatic embryogenesis. Journal of Applied Genetics, 140 pkt MEiN, IF=2,65. https://doi.org/10.1007/s13353-022-00717-9
• Czembor, E., Kaczmarek, Z., Pilarczyk, W., Mańkowski, D.R., Czembor, J.H. (2022) Simulating Spring Barley Yield under Moderate Input Management System in Poland. Agriculture, 12:1091. 100 pkt MEiN, IF=3,41. https://doi.org/10.3390/agriculture12081091
• Orłowska, R. (2022) Triticale doubled haploid plant regeneration factors linked by structural equation modeling. Journal of Applied Genetics, 140 pkt MEiN, IF=2,65. https://doi.org/10.1007/s13353-022-00719-7
• Pachota, K.A.; Orłowska, R.; Bednarek, P.T. (2022) Medium composition affects the tissue culture‑induced variation in triticale regenerants. Plant Cell, Tissue and Organ Culture (PCTOC). 100 pkt. MEiN, IF=2,71. https://doi.org/10.1007/s11240-022-02327-z
• Spyroglou, I., Rybka, K., Czembor, P., Piaskowska, D., Pernisová, M. & Matysik, P. (2022) Higher alterations in leaf fluorescence parameters of wheat cultivars predict more extensive necrosis in response to Zymoseptoria tritici. Plant Pathology, 00, 1–13. 140 pkt MEiN, IF=2,59. https://doi.org/10.1111/ppa.13569
• Stefański P, Siedlarz-Slowacka P., Matysik P., Rybka K. (2022) Efficiency of LED Lamps used in cereal crop breeding greenhouse. International Journal of Agricultural and Biological Engineering, 15(2): 75–83. 70 pkt. MEiN, IF=2,03. https://doi.org/10.25165/j.ijabe.20221502.5775
• Czembor J.H., Czembor E., Suchecki R., Watson-Haigh N.S. Genome-Wide Association Study for Powdery Mildew and Rusts Adult Plant Resistance in European Spring Barley from Polish Gene Bank. Agronomy, 2022, 12(1):7. 100 pkt MEiN, IF=3,417. https://doi.org/10.3390/agronomy12010007
• Oleksiak, T., Spyroglou, I., Pacoń, D., Matysik, P., Pernisova, M., Rybka, K. Effect of drought on wheat production in Polnad between 1961 and 2019. Crop Science 2022, 1-6. 100 pkt MNiSW, IF=2,319. https://doi.org/10.1002/csc2.20690
• Bilska-Kos, A.; Pietrusińska, A.; Suski, S.; Niedziela, A.; Linkiewicz, A.M.; Majtkowski, W.; Żurek, G.; Żebrowski, J. Cell Wall Properties Determine Genotype-Specific Response to Cold in Miscanthus × giganteus Plants. Cells 2022, 11(3), 547. 140 pkt. MNiSW, IF=6,600. https://doi.org/10.3390/cells11030547
• Niedziela, A.; Domżalska, L.; Dynkowska, W.M.; Pernisová, M.; Rybka, K. Aluminum Stress Induces Irreversible Proteomic Changes in the Roots of the Sensitive but Not the Tolerant Genotype of Triticale Seedlings. Plants 2022, 11(2), 165. 70 pkt. MNiSW, IF=3,935. https://doi.org/10.3390/plants11020165
• Orłowska, R.; Pachota, K.A.; Androsiuk, P.; Bednarek, P.T. Triticale Green Plant Regeneration Is Due to DNA Methylation and Sequence Changes Affecting Distinct Sequence Contexts in the Presence of Copper Ions in Induction Medium. Cells 2022, 11(1), 84. 140 pkt. MNiSW, IF=6,600. https://doi.org/10.3390/cells11010084
• Martyniak, D.; Prokopiuk, K.; Żurek, G.; Rybka, K. (2022) Measuring fluorescence as a means to evaluate the physiological reaction to growth retardant applied to manage turf. Agronomy. 100 pkt. MEiN, IF=3,95. https://doi.org/10.3390/agronomy12081776
• Bednarek, P.T.; Orłowska, R.; Mańkowski, D.R.; Zimny, J.; Kowalczyk, K.; Nowak, M.; Żebrowski, J. (2022) Glutathione and copper ions as critical factors of green plant regeneration efficiency of triticale in vitro anther culture. Frontiers in Plant Science, 13:926305. 100 pkt. MEiN, IF=6,63. https://doi.org/10.3389/fpls.2022.926305

2.  Projekty realizowane w Zakładzie Biochemii i Biotechnologii

• Dotacja Celowa MRiRW na rok 2021
  1. Zadanie: 3.1. Identyfikacja źródeł genetycznych pszenicy do hodowli odmian pożądanych w produkcji żywności funkcjonalnej przy zastosowaniu nowej metody profilowania makromolekularnego biopolimerów w mikroskali. Kierownik: dr hab. M.Cyran, prof. IHAR-PIB
  2. Zadanie 3.2. Wytworzenie linii DH (podwojonych haploidów) pszenżyta z genami dopełnienia męskiej sterylności i przywracania płodności. Kierownik: dr S.Oleszczuk
  3. Zadanie 3.3. Przeniesienie zdolności do androgenezy z linii modelowych do linii hodowlanych żyta oraz identyfikacja czynników genetycznych determinujących androgenezę. Kierownik: prof. dr hab. J.Zimny
  4. Zadanie 3.4 (realizowane wspólnie z Zakładem Biologii Stosowanej) Nowe źródła genetyczne i celowane markery molekularne dla hodowli odpornościowej jęczmienia. Kierownik: dr hab. P.Czembor, prof. IHAR-PIB
  5. Zadanie 3.5. (realizowane wspólnie z Zakładem Bioenergetyki, Analiz Jakości i Nasiennictwa) Wyodrębnienie form roślin uprawnych o podwyższonej odporności na okresowe niedobory wody. Kierownik: prof. dr hab. G.Żurek
• Postęp Biologiczny w Produkcji Roślinnej
  1. Zadanie 29: (realizowane wspólnie z IHAR-PIB o/Jadwisin) Poszukiwanie specyficznych reakcji warunkujących tolerancyjność genotypów ziemniaka na wysoką temperaturę i suszę. Kierownik: dr D.Boguszewska-Mańkowska
• Agrobank - Gospostrateg 1/394826/10/NCBR/2018: Stworzenie bioinformatycznego systemu zarządzania narodowymi zasobami genowymi roślin użytkowych oraz rozwój kapitału społecznego i gospodarczego Polski poprzez ochronę i wykorzystanie tych zasobów w procesie świadczenia usług doradztwa rolniczego. Kierownik: prof. dr hab. J.Czembor
  • http://bip.ihar.edu.pl/artykul/122/540/agrobank-gospostrateg-1-394826-10-ncbr-2018
  • ​https://www.cdr.gov.pl/projekty-i-wspolpraca/projekty-krajowe/121-projekty-i-instytucje-wspolpracujace/agrobank
  • Zarządzenie nr 1/D/2022 w sprawie powołania Komitetu Koordynacyjnego ds. Zasobów Genowych i Transferu Wiedzy i Innowacji do Praktyki Rolniczej - AGROBANK
  • Strategia Wykorzystania Zasobów Sieci Banku Genów IHAR-PIB w POLSCE do 2028
  • AGROBANK - Prezentacja (MRiRW)
  • AGROBANK - Prezentacja